Nobunagun – Shio Ogura adalah siswa sekolah menengah Jepang, yang mengunjungi Taiwan dalam perjalanan sekolah ketika dia tiba-tiba diserang oleh monster. Agen yang dikenal sebagai “Pemegang E-Gene” dari agen pemerintah DOGOO juga tiba, yang memegang senjata yang diresapi dengan roh tokoh sejarah. Shio terungkap juga menjadi Pemegang E-Gene ketika jiwa Oda Nobunaga terbangun setelah dia mencoba menyelamatkan seorang teman.