Gunslinger Stratos: The Animation – A.D. 2115—negara kepulauan yang pernah disebut Jepang sekarang dikenal sebagai “Distrik Manajemen Kota Kekaisaran Timur Jauh ke-17”.Warga dijanjikan kehidupan yang damai dengan imbalan beberapa kenyamanan yang biasa mereka miliki. Orang percaya hidup mereka tidak akan pernah berubah dan besok akan sama seperti hari ini. Tidak ada yang menduga malapetaka yang akan datang yang akan dihadapi masyarakat mereka.“Degradasi”—penyakit langka yang menyebabkan kehancuran total tubuh manusia menjadi tumpukan pasir perlahan tapi pasti menyebar ke seluruh dunia.Tohru Kazasumi, seorang siswa biasa menjadi terlibat dalam pertempuran multi universal antara dunianya dan dunia paralel “Frontier S (Stratos).” Ini berarti Tohru harus melawan dirinya sendiri dari dunia alternatif.Masa depan mereka bertabrakan saat jalan mereka bersilangan.Akankah kedua dunia menemukan kedamaian?